Шон Патрик Флэнери родился в Лейк Чарльз, а вырос в Хьюстоне (США). У Шона есть дочка Лола от первого брака, и сын от второго брака с фотомоделью Лорен Мишель Хилл.
Флэнери имеет чёрный пояс по бразильскому джиу-джитсу и чёрный пояс по каратэ. У него есть собака До́унат (англ. Donut — Пончик), названная так в честь пончиков, которые она ела, когда её приютил Флэнери.
Американский киноактёр ирландского Шон Патрик Флэнери происхождения, известный такими ролями, как Коннор МакМанус в «Святых из трущоб» и «Святых из трущоб 2» и Индиана Джонс в «Хрониках молодого Индианы Джонса».